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非特异性扩增是显著影响 PCR 性能的主要问题之一,它会导致一个或多个问题:靶标扩增子产量低、靶标扩增子的检测灵敏度降低、解读结果不可靠、下游应用效果差。
非特异性扩增是显著影响 PCR 性能的主要问题之一,它会导致一个或多个问题:靶标扩增子产量低、靶标扩增子的检测灵敏度降低、解读结果不可靠、下游应用效果差。
非特异性扩增的一个常见来源是 DNA 聚合酶对错配序列的延伸和引物二聚体的形成。避免非特异性扩增的一个方法是在冰上制备 PCR 反应混合物。 较低的温度有助于降低 DNA 聚合酶的活性;然而,在 PCR 开始之前,仍可能合成出非目标产物。另一种解决方法是使用热启动 DNA 聚合酶。热启动修饰抑制了 DNA 聚合酶在室温下的活性,防止了非特异性扩增的假条带。
热启动 PCR 方法使用酶修饰剂,如化学基团、抗体、Affibody 分子(亲合体)或适体(aptamer)。最常用的两种方法是化学修饰和抗体修饰。虽然它们在室温下都能抑制聚合酶的活性,但它们之间有一些关键的区别。
热启动技术 | 特点 | 注意事项 |
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化学修饰 聚合酶与化学基团共价连接,在室温下阻断酶的活性。 示例:AmpliTaq Gold DNA 聚合酶 |
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抗体 聚合酶在其活性部位被抗体结合,在室温下阻断酶的活性。 示例:DreamTaq 热启动 DNA 聚合酶,Platinum II Taq热启动DNA 聚合酶,Platinum SuperFi II DNA 聚合酶 |
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亲合体(Affibody) 分子 聚合酶在其活性部位被 Affibody 分子(α螺旋肽)结合,在室温下阻断酶的活性。 示例:Phire Hot Start II DNA 聚合酶,Phusion Hot Start II DNA 聚合酶 |
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适体(Aptamer) 聚合酶在其活性部位被适体(寡核苷酸)结合,在室温下阻断酶的活性。 |
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