单细胞蛋白质组学质谱分析-赛默飞 | Thermo Fisher Scientific

概述

在用于单细胞蛋白质组学的所有方法中，质谱法 (MS) 是较无偏倚的方法。MS 可以鉴定和定量单个细胞中的数千种蛋白质、蛋白质变体和翻译后修饰 (PTM)。

成功的单细胞蛋白质组学工作流程需要考量的因素包括通量、定量、灵敏度和覆盖范围。通过与科学界合作，赛默飞世尔科技开发了创新技术，让您可以进行单细胞蛋白质组学分析，揭示细胞多样性的全局复杂性。我们近期对 Thermo Scientific Orbitrap Astral 质谱仪做出的创新可为每个细胞提供更多蛋白质所需的通量，每天可从细胞群、细胞类型和细胞状态中获得 > 数百个细胞，从而获得评估细胞异质性和罕见细胞类型的深刻见解。

Thermo Scientific Orbitrap 质谱仪提供先进的质谱分析技术，可准确鉴定和定量数千种蛋白质，具有超过五个数量级的线性动态范围和低至单细胞水平的微小变异系数。Orbitrap 质谱仪高度灵敏，可准确记录单个细胞中的蛋白质差异，并提供有意义的生物学状态观点。

了解 Orbitrap Astral 质谱仪如何在不牺牲定量准确度和精度的前提下，通过较高的通量和较深的覆盖度为单细胞蛋白质组学开辟新的视野。

让单细胞蛋白质组学成为主流：关键意见带领者的观点

了解有关推动单细胞蛋白质组学分析领域向前发展的主要科学家的更多信息。

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Thermo Scientific 单细胞蛋白质组学质谱分析平台

Thermo Scientific 单细胞蛋白质组学平台满足成功单细胞蛋白质组学技术的要求。

从 Thermo Scientific 单细胞蛋白质组学质谱分析平台可获得的益处。

准确和精确的定量分析

测定细胞中正确的蛋白质丰度
对低丰度蛋白质进行可靠、准确的定量
减少得出结果所需的测量次数

深度蛋白质组覆盖和数据完整性，提高置信度

可从单个细胞中获取数百到数千种蛋白质
宽动态范围，可发现具有生物学意义的差异表达低丰度蛋白质
基于 Orbitrap 的 DIA 单细胞蛋白质组学工作流程可提供 >99% 的数据完整性
TMT 单细胞蛋白质组学工作流程非常适合依据低水平信号而进行的微小蛋白质变化绘制

适合大量细胞的高通量以获得生物学见解

提供推断生物学模式的统计能力

强大的平台和方法

简单的日常平台操作，可对数千细胞进行分析
用于 DIA 和 TMT 单细胞蛋白质组学工作流程的自动化样本制备

工作流程

实现较高蛋白质组覆盖范围的高通量 DIA 单细胞蛋白质组学分析工作流程

基于 Thermo Scientific Orbitrap 的 DIA 单细胞蛋白质组学分析工作流程具有灵敏度、定量准确度和精确度且兼具高蛋白质组覆盖范围和数据完整性，可对单个细胞进行高可靠性、高通量表征。该工作流程仅需少量的样本制备，可提供一种无偏倚的方法，以鉴定从复杂样本中提取的表型不同细胞中的多种蛋白质。此外，该工作流程更适合表征稀有细胞的蛋白质组。

以更快的通量深入覆盖单个细胞

Erwin Schoof，丹麦技术大学细胞多样性实验室蛋白质科学和生物治疗部生物技术和生物医学系副教授

"借助 Orbitrap Astral 质谱仪，我们能够将单细胞的通量增加一倍，同时将每个细胞的蛋白质数量增加 50%。这意味着我们可以开始寻找关键的细胞决策蛋白，如转录因子、表观遗传调节因子和激酶，以更好地了解单细胞的生物学异质性。"

—— Erwin Schoof，丹麦技术大学细胞多样性实验室蛋白质科学和生物治疗部生物技术和生物医学系副教授

较高通量的 TMT 多通路单细胞蛋白质组学分析工作流程，可实现较高的定量精度和准确度

Thermo Scientific TMT 多通路技术可提供单细胞蛋白质组学分析工作流程的较高通量以及高定量精度和准确度。此外，使用 TMT 多通路技术可以增强多肽信号以进行质谱检测和测序，从而可以使用任何基于 Orbitrap 的质谱仪进行单细胞蛋白质组学研究。

使用 TMT 多通路的单细胞通量

Thermo Scientific TMT多通路技术为所有单细胞蛋白质组学分析工作流程提供高通量、高精度和准确性

现代单细胞蛋白质组学的发展

作为蛋白质组学研究的先驱和创新者，Orbitrap 质谱分析已经为定义现代无偏向单细胞蛋白质组学时代提供了示范。通过一张简要的年表了解现代单细胞蛋白质组学的发展。

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白皮书

针对单细胞蛋白质组学优化的样本制备

由于起始材料和待分析细胞的剪切数量有限，手动制备样本对于单细胞蛋白质组学研究来说并不可行。自动化解决了单细胞样本制备的许多缺点。从细胞分选和分离到质谱分析蛋白质的制备。

单细胞蛋白质组学面临的挑战和新方向

它是否会像基因组学一样成为主流？

在过去的十年，从质谱仪器的改进到新工作流程和应用的扩展，蛋白质组学取得了许多进步。过去10年间，单细胞蛋白质组学的发展前景一直是人们热议的话题，人们希望它能够成为现实。

下载白皮书来了解单细胞蛋白质组学所面临的挑战和应对这些挑战的新兴技术、单细胞蛋白质组学的改进和前景。

下载深入了解：

用于单细胞蛋白质组学的质谱仪

Orbitrap 质谱仪是单细胞蛋白质组学工作流程的核心，我们可借此获得每个细胞蕴含的大量信息。

用于需要数千个细胞才能获得真正生物学见解的实验

Thermo Scientific Orbitrap Astral 质谱仪具有从未有过的低检测水平，可从单个细胞中获得比以往更多的蛋白质。由于能够以较高的通量对单个细胞进行多通路分析，因此可以在一天内对数百个单细胞进行定量分析，使研究人员能够高效、可靠地确定细胞的生物学异质性，从而获得从未有过、可彻底改变研究工作的见解。

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用于精准定量的研究级单细胞蛋白质组学系统

TMT 多通路工作流程为单细胞蛋白质组学提供了较高通量。Thermo Scientific Orbitrap Ascend Tribrid 质谱仪上的 SPS MS3 方法可在宽浓度范围内为基于 TMT 的定量提供较高的准确度和精确度。该平台的实时搜索采集策略可提高 TMT 报告离子的比值精度，提高灵敏度并增加定量多肽总量。Orbitrap Ascend Tribrid MS 也非常适合单细胞蛋白质组学 DIA 工作流程，对需此种功能的研究人员而言亦非常适用。

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入门级单细胞蛋白质组学系统

Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480 质谱仪上的单细胞蛋白质组学 DIA 工作流程可为研究实验室提供精准的定量，以及较深的蛋白质组覆盖范围和数据完整性。对于希望执行基于 TMT 的单细胞蛋白质组学工作流程的实验室来说，多功能性的 Orbitrap Exploris 480 MS 也足以胜任。质谱仪上的 TurboTMT 智能采集功能可加快 TMT 18plex 实验的光谱采集速度，从而为单细胞蛋白质组学实验提供与 Orbitrap Tribrid 质谱仪相同的通量。

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	Thermo Scientific Orbitrap Astral 质谱仪	Thermo Scientific Orbitrap Ascend Tribrid 质谱仪	Thermo Scientific Orbitrap Exploris 480 质谱仪
理想的工作流程	DIA 单细胞蛋白质组学 TMT 单细胞蛋白质组学	DIA 单细胞蛋白质组学 TMT 单细胞蛋白质组学	DIA 单细胞蛋白质组学
理想的研究	>使用 TMT 对1000个细胞的研究使用 DIA 对 <1000个细胞的研究	>使用 TMT 对1000个细胞的研究使用 DIA 对 <500个细胞的研究	<使用 DIA 对500个细胞的研究
DIA 单细胞蛋白质组学通量	80个细胞/天	40个细胞/天	40个细胞/天
TMT 单细胞蛋白质组学通量	500个细胞/天	200个细胞/天	200个细胞/天
DIA 单细胞蛋白质组学定量准确度
TMT 单细胞蛋白质组学定量准确度
DIA 单细胞蛋白质组学定量精度
TMT 单细胞蛋白质组学定量精度
DIA 单细胞蛋白质组学蛋白质组覆盖范围
TMT 单细胞蛋白质组学蛋白质组覆盖范围
单细胞灵敏度