Thermo Scientific Pierce BS3-d0/d4 试剂形成一组匹配的重质(氘化)和轻质 BS3 胺反应性交联剂,有助于通过质谱法鉴别交联肽。
BS3-d0/d4 试剂是常用 BS3 交联剂(
产品编号 21580)的质量类似物。d-0 (BS3-d0) 具有普通氢原子,而 d-4 (BS3-d4) 含有四个氘原子,使其精确地重四个氢质量单位。当混合两种类型并将其用于交联相互作用蛋白时,产生特殊的质量模式,该模式能够明确识别交联分子。
BS3-d0d4 试剂的特点:
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氘标记 BS3 及其专门生产的用于通过质谱法进行交联蛋白结构:功能分析的标准纯氢类似物—
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易于识别交联片段—肽质量存在 4 个单位的差异可明确确定蛋白相互作用结构中特定基因座处的交联
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应用特定说明—帮助首次使用用户了解应用
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方法仅需微克级蛋白—对于需要大量蛋白、特殊溶剂或晶体形成的 NMR 或 X 线晶体学方法,是一种极好的替代方法
添加仅化学结构中氘原子数量不同的两种相同交联剂的等摩尔混合物提供了一种通过质谱法鉴别低丰度单交联肽的有效方法。交联蛋白与 BS2G-d0/d4 试剂的相互作用产生特殊的质量模式,其中在对交联蛋白或蛋白复合物进行酶切后,交联肽存在 4 个质量单位的差异。反应产物的进一步分析可产生低分辨率的三维结构信息。
BS3-d0/d4 和
BS2G-d0/
BS2G-d4 试剂是具有同型双功能、胺反应性、不可切割性、水溶性的交联剂,具有规定的间隔臂长度。这些试剂可用作蛋白结构-功能研究中空间关系估计的分子尺。两种轻质和氘化类似物在 pH 值 7-9 下均与伯胺 (—NH2) 高效反应,形成稳定的酰胺键。蛋白通常包含赖氨酸 (K) 残基侧链和每种多肽的 N-末端中的几种伯胺,作为在这些试剂中发现的两个 sulfo-NHS 酯反应性基团的靶标。这些试剂以钠盐的形式提供,可溶于水,浓度高达 10 mM。
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