Axiom™ 全基因组 LAT 1 阵列板设计用于全基因组缺失基因型填充分析美洲原住民、欧洲人和西非祖先的混合种群,重点关注疾病相关基因。这些阵列包括特定于多个 HapMap 种群的额外标志物。这些阵列具有业内较高的罕见变异覆盖度,可复制之前全基因组关联研究中发现的特定性状位点和/或基因的研究。使用缺失基因型填充技术可以实现对其他市售阵列的高成本效益、预算节省替代。
我们还提供以下较全基因组覆盖度的阵列:•
Axiom 全基因组 ASI 1 阵列板—首款设计用于较大程度提高东亚 (JPT+CHB) 共有基因组罕见等位基因 (MAF >1%) 的基因组覆盖度的阵列
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Axiom 全基因组 CHB 1 & CHB 2 阵列板—Axiom 全基因组 CHB 1 阵列板可以较大限度地提高中国汉族人基因组常见等位基因 (MAF >5%) 的基因组覆盖度。全基因组 CHB 2 阵列板设计用于靶向罕见变异 (MAF 2-5%),作为 Axiom 全基因组 CHB 1 阵列板的补充。全基因组 CHB 1 & CHB 2 阵列捆绑套装可实现 CHB 种群较全面的商业用全基因组覆盖。
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Axiom 全基因组 PanAFR 阵列板套 - 较先覆盖泛非基因组的阵列,覆盖 ˜90% 的约鲁巴人(西非)基因组常见和罕见变异 (MAF >2%),覆盖 >85% 的卢希亚部族和马赛族(东非)基因组常见和罕见变异 (MAF >2%)。该阵列集还可提供与西非祖先混合种群的高基因组覆盖度 (>85%)。
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Axiom 全基因组 EUR 1 阵列板 -全基因组 EUR 1 阵列板设计用于欧洲祖先全基因组填补分析,重点关注疾病相关基因。这些阵列包括特定于多个 HapMap 种群的额外标志物。这些阵列具有业内较高的罕见变异覆盖度,可复制之前全基因组关联研究中发现的特定性状位点和/或基因的研究。使用填补可以实现对其他市售阵列的高成本效益、预算节省替代
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Axiom 全基因组 CEU 1 阵列板我们的首款具有成本效益的阵列,可较大程度提高欧洲人群罕见变体 (MAF >1%) 的覆盖度。
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Axiom 全基因组 EAS 1 阵列板 - 东亚祖先
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Axiom 全基因组 AFR 1 阵列板 - 西非和欧洲祖先的混合人口
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Axiom 全基因组种群优化阵列的优势:每个阵列板的设计目的是实现每个目标人群 ˜90% 的基因组覆盖 (r
2 >0.8),同时在一些领域覆盖 MAF 1-5% 的标志物,例如:
•关键生物学类别(例如编码 SNP)
• 生物过程(例如药物代谢基因)
• 疾病类别(例如心血管疾病、癌症、免疫/炎症、MHC 和 CNS)
• 来自国际 HapMap 项目、1000 基因组项目和已发表疾病相关成果的常见和罕见 SNP 和插入/缺失 (indel)
• 接受过基因分型测试的基因组内容经过证明,可提供信息丰富的可靠结果
• 在重要生物学类别(比如编码 SNP)和生物途径(比如药物代谢或心血管基因)中预先选择了标记物,从而可提高覆盖度
• 高样品通过率、检出率和重现性
• 兼容 Axiom 2.0 试剂盒、GeneTitan™ MC 仪器、自动或手动工作流程以及 Genotyping Console™ 软件