Applied Biosystems Precision ID Identity Panel 是最先用于人类身份鉴定的下一代测序 (NGS) 解决方案之一,可鉴定原始样品或降解样品。SNP 的多重检测板类似于法医分析员使用的 STR 基因型匹配概率,可区分个体(1x10-31 至 6x10-35)。
通过使用具有高杂合性和低固定指数 (Fst) 的 34 个上游 Y-分支 SNP 和 90 个常染色体 SNP 来实现高区分能力,如耶鲁大学 Kenneth Kidd 博士的出版物和 SNPForID Consortium 所述 (1-3)。检测板设计针对仅使用 1 ng 起始 DNA 量的降解或复杂法医学样品进行了优化,但在使用低至 100 pg 的亚纳克起始量时观察到可接受性能。常染色体标志物的平均扩增子长度为 132 个核苷酸、Y 标志物平均长度为 141 个核苷酸。使用低至 1 ng DNA 的小样品起始量,可利用 Precision ID NGS 系统和用于分析的 Converge 软件在不到 2 天内从样品提取至得到基因型。
简单性
•小扩增子能够使降解样品的回收率更佳
•低至 100 pg 起始量
•使用 Ion Chef 系统进行自动文库和模板制备
可扩展性
•多种芯片形式,满足多种样品处理量要求
•多路处理多达 384 份样品的能力*
速度
•DNA 至数据靶向测序工作流程手动操作时间不到 45 分钟
•总样品至数据时间不到 2 天*
注:Precision ID Identity Panel 提供足够的材料,可使用手动 Precision ID 文库试剂盒(货号 A26435)执行 96 次反应或使用自动 Precision ID DL8 文库试剂盒(货号 A33212)执行 48 次反应。
*使用 Precision ID NGS 系统进行人类身份鉴定
参考资料:
1.Pakstis, AJ, Speed, WC, Fang, R, Hyland, FC, Furtado, MR, Kidd, JR, and Kidd, KK.(2010) SNP for a universal individual identification panel.Human Genetics 127(3), 315-324.
2.Phillips, C, Fang, R, Ballard, D, Fondevila, M, Harrison, C, Hyland, F, et al.(2007) Evaluation of the Genplex SNP typing system and a 49plex forensic marker panel.Forensic Science International: Genetics 1(2), 180-185.
3.Karafet, TM, Mendez, FL, Meilerman, MB, Underhill, PA, Zegura, SL, and Hammer, MF.(2008) New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree.Genome Research 18(5), 830-838.