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Ion AmpliSeq™ Direct FFPE DNA 试剂盒可制备福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织的 DNA,用于使用 Ion AmpliSeq 方案进行文库构建,无需脱蜡或 DNA 纯化。此试剂盒适用于厚度达 10 μm 的 FFPE 组织切片。
Ion AmpliSeq Direct FFPE DNA 试剂盒的特点包括: •简单的单管 2 步法方案较大程度地减少了样品损失 •效率 30 分钟工作流程,仅需 10 分钟的手动操作时间 •是含有限 DNA 量的 FFPE DNA 样品的理想选择 •FFPE 切片无需脱蜡 •无需柱或磁珠法 DNA 纯化 •只需低至 1 ng 起始量 DNA 的 Ion AmpliSeq 文库制备 •尿嘧啶 D-糖基化处理去除脱氨基化的胞嘧啶是一个可选步骤
可提取 DNA 量有限样品的 DNA 存档的组织样品可提供临床相关信息,但难以分离所含的少量核酸。这些样品中 FFPE 组织切片脱蜡和 DNA 纯化是一种复杂的多步骤程序,需要大量的手动操作时间,相关的样品损失使其不适用于处理 DNA 量有限的 FFPE DNA 样品。
更简单、更快速的方法 Ion AmpliSeq Direct FFPE DNA 试剂盒提供了一种用户友好方案,无需 FFPE 组织切片脱蜡和 DNA 纯化。在玻璃玻片上包埋的 FFPE 切片中,使用转移溶液将目标区域移出,然后移液到 PCR 管或 96 孔板中。添加 Direct 试剂后,将样品在 65°C 下孵育 15 分钟。FFPE DNA 现在可以用于 Ion AmpliSeq™ 文库制备方案。必要时,可以使用 Qubit™ HS DNA 定量试剂盒对制备的 FFPE DNA 进行定量。该方案的简化消除了复杂的脱蜡和 DNA 提取程序的需求,并可手动或使用自动 Ion Chef™ 系统来制备文库。