Ion Torrent Oncomine Childhood Cancer Research Assay 包含四个 Ion AmpliSeq 寡核苷酸引物库和相关试剂,用于在 Ion GeneStudio S5 平台上生成扩增子文库进行下一代测序 (NGS)。该检测旨在为研究人员提供对单次 NGS 运行中相关 DNA 突变和儿童和年轻成人癌症相关融合转录本的灵敏、全面的样品扩增。检测组合由203个独特基因组成:130 个关键 DNA 基因、28 个拷贝数变异靶标、90 个融合驱动基因的大 panel(有多个配对体)以及 9 个表达基因和对照。这些基因涵盖了绝大多数儿童和年轻成人的肿瘤学研究样品中较相关的靶标。
该版本检测为手动文库制备。如需使用 Ion Chef 系统进行自动化文库制备,请参阅
Oncomine 儿童癌症研究检测,Chef-Ready。
特点包括:
•简单、可靠的工作流程,包含一次 NGS 运行中两个 DNA 和两个 RNA pool 中的突变和融合
• 出色地覆盖了所有相关靶标
• 在单个 Ion 540 芯片上多重检测多达8份样品
• 与血液、骨髓或 FFPE 样品中每个文库中输入量低至 10 ng/池的 DNA 或 RNA 兼容
• 经验证的检测表明,体细胞变体降至 5% 等位基因频率
• 简单快速的工作流程,通常可在3.5小时内产生靶标文库
• 用于在 Ion GeneStudio S5 系统上手动或自动制备文库
Oncomine Childhood Cancer Research Assay 是一种综合的靶向 NGS 测定试剂盒,旨在帮助研究人员了解儿童和青少年所患癌症。该检测试剂盒是一种完全面型试剂盒,可促进从 FFPE、血液或骨髓样品中扩增多个基因靶标,DNA 或 RNA 的输入量低至 10 ng/池。
借助 Ion AmpliSeq 技术,该超高多重 NGS 检测试剂盒可在单次运行中生成多个样本的结果。适用于 Ion GeneStudio S5 测序系统,几日内便可获得结果而无需等待数周时间。该检测与 Torrent Suite 和 Ion Reporter 分析软件中的生物信息学工作流程一致,利用优化的变体调用参数进行 SNV、插入缺失、拷贝数变体和融合转录本检测。可快速、轻松地处理样品,并可靠地检测和鉴定变体。