Genexus™ 纯化系统

Ion Torrent Genexus 纯化系统能够在短短两小时内从各种类型样本中自动提取核酸，包括福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 裂解物、血浆、全血、新鲜或冷冻组织、外周血白细胞 (PBL)、培养细胞和骨髓穿刺物。系统耗材预填充有试剂，每次运行可支持多达 12 份样品（从血浆提取的 6 份样品）。系统包括一台机载 Qubit 荧光计，可实现萃取后的自动化核酸定量分析，并经过验证可使用 Genexus 集成测序系统，作为从标本至得出结果的完整工作流程中的一环。

Genexus 纯化系统可提供：
•MagMAX 技术—得出一致的萃取结果
• 预填充的耗材—有助于缩短手动处理时间
• 可视化系统—运行设置期间可提供有关耗材的实时反馈，以防止设置错误
• 集成的核酸定量分析—缩短运行后处理时间

Genexus 纯化系统在 Genexus 集成测序仪上使用时，可实现多种组织类型的自动化核酸萃取和定量分析。该纯化系统具有单个触点和 10 分钟的手动操作时间，可从 FFPE 裂解物中按顺序提取 DNA 和 RNA，从血浆中提取 cfTNA，以及从全血、新鲜或冷冻组织、骨髓或外周血白细胞中单独提取 DNA 或 RNA。Genexus 软件连接至集成测序仪后，可集成从设置到报告的工作流程至单个软件生态系统中，实现下一代测序 (NGS) 工作流程的简化。

预填充试剂
Genexus 纯化系统耗材预填充有执行萃取所必需的大多数试剂，因此每份样品仅需很少的移液步骤即可设置运行。只需移除箔封，添加酶和您的样品，然后将耗材放置在仪器上。

可视化系统
就像 Genexus 集成测序仪，Genexus 纯化系统使用机载可视化系统来验证试剂的放置并实时检测错误。可视化系统持续检查耗材是否适合纯化运行类型，并有助于防止使用已过期或之前已用过的耗材。在系统基座中的屏幕上会显示有关系统中加载耗材的反馈。

MagMAX 技术
MagMAX 技术使用磁珠执行核酸萃取。MagMAX 磁珠因其较大的表面积可提供出色的结合性能，接受更大范围的不同粘度样品，并且允许小容量样品的高效洗脱。

48‐孔核酸储存板
萃取后，所有核酸直接转移至 48‐孔储存板并在运行完成后长达一小时的时间内保持冷却。48‐孔核酸储存板带有条形码，便于在多个存储的储存板中追踪样品提取。

自动化定量分析
Genexus 纯化系统可使用 Genexus 集成测序仪实现萃取核酸的自动化定量分析。两种染料用于检测提取样品中的 DNA 或 RNA 浓度。自动化的运行后定量分析可节省手动操作时间，允许在运行完成后直接使用萃取样品进行基因分析工作流程。

快速周转
Genexus 纯化系统的运行时间从 2 到 5.5 个小时不等，具体取决于萃取样品的数量和正在运行的方案。自动化定量分析有助于显著减少运行后的手动操作时间，从而快速过渡到后续的基因分析工作流程。

运行后清洁
每次运行后，研究人员会丢弃接触样本的所有耗材，然后 Genexus 纯化系统会使用紫外光来清洁工作台。自动化紫外光清洁可防止可能的运行间核酸残留，这种残留可能导致下游测序污染。

额外的工作流程益处
Genexus 纯化系统是 Ion Torrent Genexus 系统的组成部分，该系统是第一个整体 NGS 解决方案，可自动完成从标本到报告的工作流程，并可在一天内得出结果。当 Genexus 纯化系统连接到 Genexus 集成测序仪后，额外的工作流程益处包括：
Genexus 软件—Genexus 集成测序仪的软件用于计划从标本到报告的完整工作流程。研究人员使用该软件选择 NGS 测定并分配待运行的样本。该软件可从纯化到测序和运行后样品报告全程追踪样本。
NGS 即用型测序板—当 Genexus 纯化系统连接到 Genexus 集成测序仪并作为集成工作流程的一环运行时，每种萃取核酸的预定义等分试样会从储存板转移到 NGS 即用型 96 孔核酸测序板，该板可用作样本输入至 Genexus 集成测序仪。
查看浓度—当 Genexus 净化系统与 Genexus 集成测序仪配对使用并作为集成工作流程的一环运行时，萃取核酸浓度会传输给 Genexus 软件。可以设置测定特异性核酸浓度阈值，以筛选哪些样品进行测序，或者在继续操作之前可以手动检查提取输出。核酸浓度检查可防止浪费用于数量不足样品的测序试剂。
免移液转移至 Genexus 集成测序仪—当 Genexus 纯化系统与 Genexus 集成测序仪连接并作为集成工作流程的一环运行时，萃取后核酸浓度会发送给集成测序仪的 Genexus 软件。NGS 即用型输出板免移液转移至集成测序仪，因为所提供的核酸浓度允许测序仪将核酸稀释至测序工作流程的测定特定输入量。