Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 是一个用于进行多重 PCR 的引物库,用于从人类癌症基因中经常突变的基因组“热点”区域制备扩增子文库(
下载 Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 的靶向基因和突变列表)。以原始 Ion AmpliSeq™ 癌症检测板中包括的突变为基础,较新的 Ion AmpliSeq™ 即用型检测板可提供:
•保持与 FFPE 样品的兼容性,同时扩增突变内容,以覆盖更广泛的附加基因以及“热点”突变
• 覆盖极均匀,可实现更高效的测序并节省成本
• 增强型引物设计,优化新引物集甚至可降低链偏向性,从而增加精确变异检测的可信度
• 采用 Torrent Suite 软件 v3.0 和 Variant Caller 插件可在低等位基因变异检测中改善变异检测,并改善 indel 灵敏度
用于推进癌症研究的额外突变内容 Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 设计用于扩增涵盖 50 个致癌基因和肿瘤抑制基因中约 2,800 个 COSMIC 突变的 207 个扩增子。包括来自第一版 Ion AmpliSeq™ Cancer Panel 中 46 个基因的 739 个 COSMIC 突变以及来自重要癌症基因的已添加热点突变。在保持与 FFPE 样品的兼容性并涵盖与第一版 Ion AmpliSeq™ Cancer Panel 相同的靶标的同时,我们还通过为 EZH2、GNA11、GNAQ 和 IDH2 中的热点添加多个扩增子并为其他基因添加稍长的扩增子来包括更多突变,进而帮助推进您的癌症研究。Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 应与
Ion AmpliSeq™ 文库试剂盒 2.0 配合使用。
测序更有效、性价比更高且覆盖极均匀 Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 中的改进引物设计改善了 Ion AmpliSeq™ 技术的覆盖均匀性。覆盖范围更均匀,可以使用更少的测序通量实现所有扩增子的较小深度。因此、额外样品可以使用任何 Ion 芯片进行多重分析。这样能在维持变异检测的高可信度的同时,通过更高效的测序节省成本。此外,Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 的引物集中的较低链偏向性可为精确的变异检测提供进一步的可信度。
Ion AmpliSeq™ 技术简单、快速且可扩展 通过保持 Ion AmpliSeq™ 技术的简单性,Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot Panel v2 使得能够对 FFPE 组织进行癌症基因研究,只需 10 ng DNA 上样量即可进行靶标文库构建。Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 也可维持使用标准 PCR 设备的革命性工作流程以及用于基于超高多重 PCR 的靶标选择的简单 PCR 反应,无需投入大量资金。此外,Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 继续使您能够在约 3.5 小时的较短时间内获得靶标文库。通过 Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2 也可保持可扩展性和灵活性,允许使用任何 Ion 芯片对一份样品或多通路条形码样品进行测序。
采用 Torrent Suite 软件 v3.0 改善变异检测 直观的 Torrent Suite 软件和 Variant Caller 插件让您可以从提取 DNA 至变异检测只需 10 小时。随着算法的改进,您将看到可对较低频率的等位基因进行更灵敏的 indel 检测以及更灵敏的 SNP 检测。然后可使用 Ion Reporter™ 软件在常规 DNA 测定试剂盒中进行变异注释,以推进临床研究。