用于马基因分型的 Axiom 马基因分型芯片 (Axiom MNEC670) 是通过专家设计项目由 Affymetrix 与明尼苏达大学和马遗传多样性联盟的成员合作设计而成。
*Axiom 马基因分型芯片是一种新型芯片,也是目前唯一可用于20个不同品种基因分型的芯片。它为马遗传学研究提供了很大的效用。它的特点是通过筛选 200 万个标记,选择了 670796 个标记,以实现国内马品种中已知遗传多样性的较好的基因组覆盖。
1 该芯片采用了 Axiom 基因分型解决方案,为现今可用技术提供了较高的数据完整性、识别率和可重复性。
Axiom™ 马基因分型芯片的特点:• 专家设计:由马研究组织的关键意见领袖开发
• 高分辨率:可实现96格式;可用于马研究的广泛基因分型
特点内容:• Axiom 马基因分型芯片共包括 670796 个标记:
-种内标签 SNP 约 400000 个标记
-种间标签 SNP 约 200000 个标记
-约 70000 个 SNP 来自传统芯片
-马主要组织相容性复合体内的其他 SNP 密度
多样性:Axiom 马基因分型芯片中所选的标记可较大限度地提高 20 个品种内和品种间 180 万个标记的插补准确度(图 1)。重点关注具有高度相关商业化价值的品种。
Axiom 马基因分型芯片的应用:• 复杂性状研究
-全基因组分析和精细定位
-多样性分析
-疾病风险的基因组预测
• 分子育种
-关联定位
-提高育种项目的效率
-选择特征分析
*由明尼苏达大学领导的马遗传多样性联盟 (EGDC) 代表由马研究人员组成的国际协会组织,致力于全面了解全世界马种群的遗传多样性。(
http://www.cvm.umn.edu/equinegenetics/egdc/)
所需产品GeneChip Command Console 软件GeneTitan 多通道仪