Single-Stranded DNA Binding Protein (SSB)

Single-Stranded DNA Binding Protein (SSB) 以高亲和力协同结合单链 DNA，其与双链 DNA 的结合度不高。与单链 DNA 结合后，SSB 使螺旋二聚体变得不稳定，因此 DNA 聚合酶可以更容易地接触到底物。SSB 参与 DNA 复制并在体内重组。目前它也已用于在电镜下显示单链 DNA。

PCR 可通过将这种结合蛋白添加到反应液中而得到优化。SSB 可在 PCR 试验过程中添加以使变性 DNA 保持稳定，也可将其用作一种 PCR 反应添加剂，以此保护 ssDNA 不被核酸酶消化。 研究表明 SSB 通过直接或间接作用于聚合酶，增加链置换活性以及对引物模板的亲和力，从而可改善复杂模板下的 PCR 性能。

SSB has also been used in conjunction with RecA protein for carrying out site-directed mutagenesis and to select sequences from libraries of double-stranded DNA. 研究表明 SSB 可最大程度减少 PCR 产物中的缺失诱变假象，从而增加 PCR 产量。

SSB may also stimulate specific DNA polymerases used in DNA sequencing reactions and has been used to target restriction endonuclease digestions to specific sites in single-stranded DNA for subsequent mutagenesis.

研究表明 SSB 可以有效进行荧光偏振测定，并消除对强二级结构进行测序时的停顿现象。最近，SSB 用来帮助在焦磷酸测序中获得更长的读序长度，以供 SNP 分析使用。

Properties
Consists of four identical 18.9 kDa subunits
Isoelectric Point: 6.0
每个单体结合的核苷酸：8-16
热稳定性：SSB 在 65°C 下孵育 20 分钟后保持活性。

纯度
SDS-PAGE 测得的纯度大于 95%。已对是否受到非特异性核酸内切酶、核酸外切酶及核糖核酸酶污染进行过检测。

Storage Buffer
50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 200 mM NaCl, 0.1 mM EDTA, 1.0 mM DTT, 50% glycerol.

Activity
Approximately 5 μg of SSB protein is required to prevent optical density change of 1 μg of single-stranded DNA upon addition of 10 mM MgCl₂.

Concentration
5 μg/µL; measured by A₂₈₀

Source
E. coli strain containing an overproducing clone of E. coli SSB protein.

Applications:
  1. 增强 DNA 聚合酶活性
  2。 荧光偏振测定
  3。 允许在焦磷酸测序中获得更长的读序长度用于 SNP 分析
  4。 对具有强二级结构的单链或双链 DNA 测序时消除停顿现象
  5。 提高限制性内切酶消化水平
  6。 定点突变与 recA


相结合