MicrobeBridge™ 软件

MicrobeBridge™ 软件是一种桌面软件解决方案，将 Applied Biosystems™ Sanger 测序仪上生成的 .ab1 数据文件与美国疾病控制与预防中心 (CDC) 的 MicrobeNet™ 数据库连接起来，从而通过 16S rRNA 基因测序分析进行细菌鉴定。

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MicrobeNet 是一种基于网络的工具，由 CDC 构建，用于通过 16S rRNA 基因序列 BLAST 搜索功能进行微生物病原体鉴定。’该工具包含高度精选的基因和表型特性数据库，用于鉴定细菌和微生物种属。

现行的工作流程需要对序列数据组装进行手动质量检查，对组装序列进行手动检查，以及使用 Genbank 进行手动比对搜索以鉴定物种。MicrobeBridge 软件则提供了简化的工作流程，首先是导入由任意一款 Applied Biosystems 毛细管电泳测序仪器上生成的 .ab1 数据文件。该软件可执行重叠群组装、重叠群编辑、引物修剪、数据质量检查，以及复制重叠群序列并提供与 MicrobeNet 的一键式连接。

功能
• 读取覆盖度概览显示了样本中的正向和反向序列范围。
•重叠群概述可显示正向和反向序列，识别组装重叠群序列中的差异，并允许编辑重叠群序列。
•质量状态可根据用户可设置的质量范围显示颜色编码的跟踪文件，并提供缩略图跟踪视图以检查原始数据。
•一键式访问 MicrobeNet 提供了一键式复制重叠群序列的功能。
•允许以 FASTA 格式导出重叠群文件。

将 Sanger 测序结果无缝连接至 CDC
该软件可将 Sanger 测序数据与 CDC MicrobeNet 参考数据库无缝连接，使研究人员能够在一个数据库中鉴定微生物和其他病原体。它可以自动编译原始序列数据以与 MicrobeNet 中已知的致病序列进行匹配的过程。

系统要求
• 最低 1.8 GHz 处理器、2 GB RAM 和 20 GB 可用硬盘空间
• 软件已在 Windows 10 专业版和 Windows 7 32 位/64 位 SP1 上经过测试

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