Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达检测Panel,Chef-Ready 试剂盒可在一次检测中同时对 20,000 多种小鼠 RefSeq 基因进行基因表达检测。Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达检测可与小起始量的总 RNA 直接使用,适用于对获取全面和高灵敏度基因表达测定(从多种 RNA 来源中)感兴趣的人员。该特殊的试剂盒能够在 Ion Chef 系统上自动构建 Ion AmpliSeq 转录组文库。有关手动操作,请参见
Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达试剂盒。
Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达检测Panel Chef-Ready 试剂盒提供:
•灵活、直接的文库制备—以从组织、细胞或其他来源中制备的低至 10 ng 的总 RNA 为起始量
• 简单的工作流程实现快速基因表达谱分析—可在 ∼2 天内从 RNA 样品中获取数据,手动操作时间总共只需 <45 分钟,并利用 Ion GeneStudio S5 和 Ion Chef 系统实现工作流程自动化
• 配备用于自动测序分析的补充软件插件,可提供基因定量测定和报告以及质量控制指标
• 与 Ion Xpress 条形码接头兼容,可实现多通路测序
此超高多重 PCR 富集方法充分利用了 Ion AmpliSeq 技术的速度和简便性,可实现快速基因表达谱分析,同时极大限度地缩短手动操作时间。该研究方法提供了更快、更简单、成本更低的测序方法,与全转录组 RNA 测序高度相关。
使用 Chef-Ready 试剂盒进行直接的文库制备和多重测序Ion AmpliSeq 转录组小鼠基因表达检测Panel Chef-Ready 试剂盒包含自动制备 32 个带条形码的 Ion AmpliSeq 转录组文库所需的试剂和材料。Ion Chef 系统每次运行最多八个带条形码的文库同时实现自动化建库,因此该试剂盒可提供足够四次运行的试剂和材料。以低至 10 ng 的总 RNA 为起始量,首先使用 SuperScript VILO cDNA 合成试剂盒(不含)处理总 RNA,然后使用 Ion AmpliSeq 技术扩增所得的 cDNA 以准确维持所有基因的表达水平。大约需要 7 小时的仪器运行时间加上短短 15 分钟的手动操作时间,即可完成 Ion Chef 系统的设置以进行 cDNA 文库构建。
文库构建完毕后,即可使用 Ion Chef 系统进行下游模板制备,然后在 Ion GeneStudio S5 或 Ion Proton 测序系统上进行测序。推荐 16 个文库每张Ion 550 芯片和 8 个文库每张Ion 540 或 Ion PI 芯片,使文库使用更灵活,增加检测通量,降低成本。也可以选择其他多重分析方法,这取决于实验设计和所需的灵敏度水平。