AgriSeq™ 犬性状和遗传病Panel

Applied Biosystems AgriSeq 犬性状和遗传病Panel涵盖了靶向临床上重要的犬性状和遗传病相关的154个标记。此Panel包含 SNP 位点和复杂标记，如 MNP 和 InDel。这些标记大多数是所有品种共有的，但其中也有些对于特定性状和遗传病具有品种特异性。AgriSeq 犬性状和遗传病Panel采用 AgriSeq 靶向测序法基因分型 (GBS) 工作流程实现多重同时基因分型。使用 CanFam 3.1 参考基因组进行分析。

需要对信息性遗传标记进行高度一致性检测，这对于遗传性状检测至关重要。靶向 GBS 方法（例如 AgriSeq）比非靶向 GBS 方法（例如 RADSeq）更有优势，后者很容易受到等位基因脱扣和丢失数据的影响。使用 AgriSeq 工作流程，能够在各种样品混池中以高度可重现的方式同时靶向数百至数千标记。通过与多名专家和 ISAG 成员实验室合作，我们开发并验证了Panel中所有标记的性能，包括 97 个 SNP、6 个 MNP、13 个插入和 38 个缺失。采用正交试验、稳定性试验和使用不同犬口腔拭子 DNA 样本的田间试验验证了Panel的性能。全面的 AgriSeq 犬性状和遗传病Panel设计用于为临床上重要的遗传疾病和性状提供可靠的基因分型结果。

AgriSeq 犬性状和遗传病Panel的特点包括：
•靶向136种遗传疾病和18种性状的154个标记的可重现基因分型
• 简单、高通量的工作流程
• 可定制，以与兼容的亲缘关系和身份鉴定标记配合使用

标记平均样本检出率 >99%
高基因型检出率和可重现性是准确预测性状和疾病的必要条件。使用 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程检测高度多样化的犬口腔拭子 DNA 田间样本，大多数标记获得 99.5% 的平均样本检出率（见下图）。重复基因型一致性 >99.9%，且检出与正交数据高度一致 (>99%)。

简单、高通量的工作流程
AgriSeq 犬性状和疾病检测组合经过优化，适用于 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程。每张测序芯片可混合多达 768 份个体样本，大大降低了每只动物的测序成本和工作量。一天可处理多达 4 个 384 孔板的样品，只需三天即可获得全部测序结果。AgriSeq 工作流程的灵活性允许将数百个样本混池，通过单次测序运行，并同时靶向成百上千个标记。

可与犬亲缘关系检测和鉴定Panel或其它定制Panel合并，以最大化每次检测的信息量。
AgriSeq 靶向 GBS 工作流程高度灵活，允许添加兼容的标记和Panel，从而实现高效、高价值的基因分型。无论您是希望将亲缘关系分析与特定的感兴趣性状的标记相结合，还是与遗传缺陷标记相结合，以在育种计划中剔除携带者，我们专业的农业基因组学生物信息学专家团队都可以帮助您设计高性能的Panel。

AgriSeq 犬性状和遗传病Panel，以及 AgriSeq 工作流程，为犬性状和遗传病的基因分型提供了一种精简且具有成本效益的方法。

注：CanFam 3.1 参比基因组和 AgriSeq 犬性状和遗传病Panel分析所需的其它文件可通过联系技术支持获得。