AgriSeq™ 犬 SNP 亲缘关系和个体识别Panel

Applied Biosystems AgriSeq 犬 SNP 亲缘关系和个体识别Panel涵盖了381个 SNP 标记，通过靶向测序法基因分型 (GBS) 方法用于犬的亲缘关系检测与鉴定。此Panel使用 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程实现多重同时基因分型。使用 CanFam 3.1 参考基因组进行分析。

遗传性状检测特别需要对信息性遗传标记进行高度一致的检测。靶向 GBS 方法（例如 AgriSeq）比非靶向 GBS 方法（例如 RADSeq）更有优势，后者很容易受到等位基因脱扣和丢失数据的影响。采用 AgriSeq 工作流程，能够在各种不同样品中高度可重现地同时靶向数百至数千个标记。通过与多位专家和 ISAG 成员实验室合作，我们开发并验证了Panel中全部的 381 个 SNP 标记的性能。使用正交试验、稳定性试验和采用不同的犬口腔拭子 DNA 样本的田间试验验证了Panel的性能。另外，使用 2019 ISAG/ICAR 犬 SNP 分型第二对比样本盘对此Panel进行了确认。全面的 AgriSeq 犬 SNP 亲缘关系检测和鉴定Panel可提供可靠的基因型结果，用于亲缘关系检测和鉴定验证。

AgriSeq 犬 SNP 亲缘关系检测和鉴定Panel的特点包括：
•实现381个 SNP 标记的可重现基因分型，用于亲缘关系检测和身份鉴定
• 简单、高通量的工作流程
• 可定制，以与兼容的性状和疾病标记配合使用

标记平均样本检出率 >99.5%
高基因型检出率和重现性是准确测定亲缘关系和身份的必要条件。使用 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程对高度多样化的犬口腔拭子 DNA 田间样本进行评估，大多数标记可获得 98.5% 的平均样本检出率（见下图）。重复基因型一致性 >99.9%，且检出与正交数据高度一致 (>99%)。

简单、高通量的工作流程
AgriSeq 犬 SNP 亲缘关系和身份鉴定检测组合经过优化，适用于 AgriSeq 靶向 GBS 工作流程。每张测序芯片可混合多达 768 份个体样本，大大降低了每只动物的测序成本和工作量。一天内可处理多达 4 个 384 孔板，只需三天即可获得全部测序结果。AgriSeq 工作流程的灵活性允许将数百个样本混合在单次测序运行中，并靶向成百上千个标记。

可与 AgriSeq 犬性状和遗传病Panel或与其它标记合并，以最大化检测价值。
AgriSeq 靶向 GBS 工作流程高度灵活，允许添加兼容的标记和Panel，从而进行高效、高价值的基因分型。无论您是希望将亲缘关系分析与特定期望性状的标记相结合，还是与遗传缺陷标记相结合，以在育种计划中剔除携带者，我们专业的农业基因组学生物信息学专家团队都可以帮助您设计高性能的Panel。

AgriSeq 犬 SNP 亲缘关系检测和鉴定Panel，配套 AgriSeq 工作流程，为犬 SNP 亲缘关系鉴定和个体识别提供了一种简易且具有成本效益的方法。

注：分析 AgriSeq 犬 SNP 亲缘关系检测和鉴定Panel所需的 CanFam 3.1参比基因组可通过联系技术支持获得。