Ion Torrent™

Oncomine™ Comprehensive Assay Plus,自动文库制备

货号: A49667
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Oncomine Comprehensive Assay Plus 是一种靶向下一代测序 (NGS) 测定,可提供适用于实体瘤的福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织的全基因组表达谱分析解决方案。该测定可检测与靶向和免疫检查点治疗(用于癌症研究)相关的多个生物标记物。它能够同时分析 DNA 和 RNA,以在单个工作流程中同时检测多种类型的变体,包括单核苷酸变体 (SNV)、插入和缺失 (InDel)、拷贝数变体 (CNV)、BRCA1 和 BRCA2 大型基因组重排 (LGR)、基因组不稳定性指标 (GIM)、微卫星不稳定性 (MSI) 以及肿瘤突变负荷 (TMB)、杂合性缺失 (LOH) 和以 FusionSync 为特征的基因融合。

该测定的主要特点包括:
•分析500余种独特基因,以获得关于单基因和多基因生物标志物的见解
•可以分析各种单基因变体,如 SNV、indel、融合、剪接变体和 CNV(包括拷贝数增加和损失) 
•检测与免疫疗法(如 TMB 和 MSI)相关的复杂生物标记物
•通过检测46个 HRR 基因的突变(包括 BRCA LGR),并使用基因组不稳定性指标 (GIM) 评估基因组瘢痕,支持同源重组缺陷 (HRD) 研究
•性能稳健,能够检测从 FFPE 样品(包括细针活检样品)中分离出的低至 20 ng 的 DNA/RNA
•由 Oncomine 知识库和经验丰富的科学家提供内容支持,帮助确保关键靶标的覆盖率与公开证据一致
•Oncomine Comprehensive Assay Plus 针对高度自动化的工作流程和简化的生物信息学分析管线进行了优化,有助于收获发现

Oncomine Comprehensive Assay Plus 为 Ion Chef 系统提供了试剂,用于从四个多通路 PCR 引物池—两个 DNA 和两个 RNA—中自动构建文库,以便使用 Ion Chef 仪器从福尔马林固定、石蜡包埋 (FFPE) 肿瘤样本中自动制备扩增子文库。该检测方法旨在帮助您从几百个癌症驱动因子中选出几个相关驱动因子,作为整体工作流程的一部分,使您只需 10 ng 核酸/pool 即可进行 NGS 数据分析。该检测试剂盒针对在 Ion GeneStudio S5 系统上使用 Ion 550 芯片测序进行了优化,每次运行最多可处理 4 份样本和1份无模板对照 (NTC)。

与 Oncomine Reporter 软件结合使用时,您可以专注于研究癌症的关键驱动基因。

从样品到结果
Oncomine Comprehensive Assay Plus 是 NGS 工作流程的一部分,可帮助研究人员从几百个癌症驱动因子变体中过滤出几个关键变体结果。在 Oncomine 信息学的支持下,这种过滤有助于您了解和解读研究结果,顺利获取您所需的答案。

了解有关 Oncomine 肿瘤学的更多信息 ›
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

规格

样品类型
DNA, RNA
Sequencing Type
新一代测序
适用于(设备)
Ion GeneStudio™ S5 Prime 系统,Ion Chef™ 仪器
靶向测序文库(基于扩增子)
产品线
Oncomine
工作流程步骤
文库生成

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    引用和文献

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