Gene-expression-analysis

基因表达分析是一种实时荧光定量 PCR 应用,在从基础研究到未来疫苗和治疗开发的多种 SARS-CoV-2 研究领域都发挥着重要作用。识别关键基因表达通路和网络对于了解冠状病毒的发病机制、趋性和传播至关重要。

基因表达分析需要高质量 RNA 以进行实时荧光定量 RT-PCR。选择最适合您的样本类型和产量需求的 RNA 分离方法。

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TaqMan 基因表达测定选择

我们的 Applied Biosystem TaqMan 基因表达测定包括靶标引物和优化的序列特异性探针(无需额外设计、优化或熔解曲线分析)。从下搜索适用于与 SARS-CoV-2 病毒和宿主靶标研究相关且精心挑选的基因列表的预设计检测试剂测定,或搜索我们包含 230 多万种基因表达测定的数据库以寻找其他目标靶标。TaqMan 测定可提供四种规格 以符合您的实验通量需求:单管、96孔板(0.1 和 0.2 mL)、TaqMan 阵列卡或 OpenArray 板。为了同时查询与 SARS-CoV-2 感染和发病机制相关的多种基因,我们还提供精心挑选的测定组合,以简化您的工作流程。

在病毒检测和定量测定方面,我们目前可提供三种适用于 SARS-CoV-2 病毒基因靶标的预设计基因表达测定。

病毒基因靶标测定 ID
SARS-CoV-2N(N 基因)vi07918637_s1
SARS-CoV-2S(S 基因)vi07918636_s1
Orf1ab 基因APH6D4Y

列出的前两种测定也可作为以下盘存检测组合的一部分提供:

检测组合描述
TrueMark 呼吸道检测组合 2.0(OpenArray 板)表征 32 种呼吸道病毒和细菌微生物
TrueMark 呼吸道检测组合 2.0(TaqMan 阵列卡)表征 41 种呼吸道病毒、细菌和真菌微生物

为了研究宿主靶标的差别基因表达,我们预设计的 TaqMan 基因表达测定产品组合包括超过 230 万种预设计的引物/探针集,涵盖 30 多个种属。  

下表列出了与 SARS-CoV-2 研究相关的一些常被引用的基因。其中许多基因也在我们精心挑选的检测组合中提供,可用于同时分析与 SARS-CoV-2 感染相关的多种宿主基因。

病毒进入因子限制因子细胞因子促炎 & 细胞毒性介质趋化因子&受体其他靶标
ACE2 (232)BST2 (36)IL1B (77)GNLY (21)CCL2 (20)HGF  (217)
ANPEP (220)CH25H (18)IL2 (51)GZMA (51)CCL3 (12)IFIT1 (13)
BSG (85)CLEC4D (44)IL4 (55)GZMB (18)CCL5 (36)IFNGR1 (91)
CLEC4G (78)DNAJC6 (220)IL5 (46)GZMK (43)CCL11 (23)IFNGR2 (61)
CTSB (118)ELF1 (118)IL6 (58)CXCL3 (11)CCL20 (44)IFT43 (133)
CTSL (50)IFIT3 (15)IL7 (66)CXCL9 (38)CCL27 (29)ISG15 (15)
DPP4 (340)IFITM1 (11)IL8 (53) /
CXCL8 (40)
IFNB1 (16)CCR1 (21)KRT4 (63)
FURIN (173)IFITM2 (5)IL10 (66)IFNG (48)CCR5 (22)KRT7 (57)
NRP1 (227)IFITM3 (11)IL12 (186)KLRB1 (27)CXCL1 (17)SCGF (8)
TMPRSS11A (51)LY6E (28)IL13 (45)KLRC1 (31)CXCL3(11)STAT1 (292)
TMPRSS11B (47)REC8 (218)IL16 (164)KLRC2 (10)CXCL9 (38)VEGF (166
TMPRSS2 (124)ZBP1 (76)IL18 (39)KLRD1 (44)CXCL10 (41) 
TMPRSS4 (136)ZC3HAV1 (149) m-CSF (63)CXCL12 (48) 
   MIF (26)  
   PRF1 (21)  
   TGFB1 (83)  
   TGFB2 (86)  
   TNF (58)  
   TNFSF10 (63)  

未看到您感兴趣的基因?可通过基因或测定 ID 搜索其他预设计的测定 ›

TaqMan 灵活阵列包括一个精心挑选并经科学选择的基因表达测定列表,这些测定根据与特异性信号转导通路或疾病状态相关的常被引用的基因而设计。检测组合提供多种配置和种属,可修改以轻松添加或删除测定/目标基因,或更改您所需的设计。

我们目前提供三种针对冠状病毒研究的 TaqMan® 灵活内容检测组合:

检测组合

描述

基因

宿主种属

冠状病毒进入因子

SARS-CoV-2 和其他冠状病毒劫持感染细胞的 13 种常被引用的宿主因子

ACE2、TMPRSS2、TMPRSS4、TMPRSS11A、TMPRSS11B、BSG、ANPEP、CLEC4G、FURIN、CTSL、CTSB、DPP4 和 NRP1


小鼠
大鼠

冠状病毒限制因子

已知能抑制冠状病毒生命周期不同阶段的 13 种常被引用的抗病毒宿主因子

LY6E、IFITM1、IFITM2、IFITM3、ZAP/ZC3HAV1、BST2、CLEC4D、ELF1、REC8、IFIT3、DNAJC6、ZBP1、CH25H
小鼠
大鼠

冠状病毒免疫信号转导

涉及对 SARS-CoV-2 和其他冠状病毒的免疫应答的 29 种细胞因子、趋化因子和生长因子

IL1B、IL2、IL4、IL5、IL6、IL7、IL10、IL12、IL13、IL16、IL18、IFNB1、IFNg、TNF、TGFB1、M-CSF/CSF1R、MIF、VEGF、SCGF、HGF、TRAIL/TNFSF10、CCL2、CCL3/MIP1a、CCL5、CCL11、CCL27、CXCL1、CXCL10、CXCL12


小鼠
大鼠

除冠状病毒灵活内容检测组合外,我们还提供多种盘存 TaqMan 检测组合,包括卡和平板规格,用于免疫信号转导通路的基因表达分析。
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您还可以浏览我们的综合数据库,查找其他适用的灵活检测组合。
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如果无法找到适合您目标靶标的预设计 TaqMan 测定,我们提供两种选择,可进行定制,同时保留 TaqMan 试剂的预期高质量、重现性和金标准化学性质。

  • 定制 TaqMan 基因表达测定:使用我们的 定制 TaqMan 测定设计工具,以利用我们预设计的实时荧光定量 PCR 5' 核酸酶 TaqMan 测定的精确设计管线。提供您感兴趣的靶标序列,然后提交进行测定设计。
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  • 定制引物和探针:使用您自己的设计管线,然后从我们的双标记 TaqMan 探针和未标记寡核苷酸系列中进行选择,用作实时荧光定量 PCR 的引物。
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对于基因表达分析,我们建议将以下测定作为阳性对照,以监测 RNA 纯化效力并确保不存在实时荧光定量 PCR 抑制剂 

阳性对照测定 ID
Xeno 对照Ac00010014_a1
人 RNase P 对照Hs04930436_g1

选择预混液

选择用于基因表达分析的预混液,具体取决于您执行 1 步法实时荧光定量 RT-PCR 还是 2 步法实时荧光定量 RT-PCR。1 步法工作流程可减少污染并缩短总体 RT-PCR 运行时间,而 2 步法工作流程可让您保存 cDNA。如果您执行 2 步法实时荧光定量 RT-PCR,您还需要购买用于逆转录反应的其他预混液。

了解有关 1 步法和 2 步法实时荧光定量 RT-PCR 的更多信息 ›
了解有关用于 2 步法实时荧光定量 PCR 的逆转录产品的更多信息 ›

我们推荐以下适用于大多数基因表达分析需求的预混液。但您也应查看随测定提供的文件,以了解任何工作流程的特定需求。

探索工作流程中每个步骤的解决方案:

请试用我们性能卓越的 TaqMan Fast Advanced 预混液。索取样本 ›

索取转化研究样本 ›

*在 ISO13485 工厂生产的通用试剂,贴有仅供实验室使用标签。

实时荧光定量 PCR 和数据分析

我们可为所有研究需求提供实时荧光定量 PCR 仪器,从预算友好型到实现较高生产率的高通量仪器。
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在您订购测定后,我们将提供特定于您的测定规格的方案和文件,供您下载。
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对于数据分析,我们建议使用云端平台 Connect 上的 Quantstudio Design & Analysis (DA2) app 。

COL111051-QS-Pro-FHRamily-4-v2-F-650x600

基因表达分析需要高质量 RNA 以进行实时荧光定量 RT-PCR。选择最适合您的样本类型和产量需求的 RNA 分离方法。

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TaqMan 基因表达测定选择

我们的 Applied Biosystem TaqMan 基因表达测定包括靶标引物和优化的序列特异性探针(无需额外设计、优化或熔解曲线分析)。从下搜索适用于与 SARS-CoV-2 病毒和宿主靶标研究相关且精心挑选的基因列表的预设计检测试剂测定,或搜索我们包含 230 多万种基因表达测定的数据库以寻找其他目标靶标。TaqMan 测定可提供四种规格 以符合您的实验通量需求:单管、96孔板(0.1 和 0.2 mL)、TaqMan 阵列卡或 OpenArray 板。为了同时查询与 SARS-CoV-2 感染和发病机制相关的多种基因,我们还提供精心挑选的测定组合,以简化您的工作流程。

在病毒检测和定量测定方面,我们目前可提供三种适用于 SARS-CoV-2 病毒基因靶标的预设计基因表达测定。

病毒基因靶标测定 ID
SARS-CoV-2N(N 基因)vi07918637_s1
SARS-CoV-2S(S 基因)vi07918636_s1
Orf1ab 基因APH6D4Y

列出的前两种测定也可作为以下盘存检测组合的一部分提供:

检测组合描述
TrueMark 呼吸道检测组合 2.0(OpenArray 板)表征 32 种呼吸道病毒和细菌微生物
TrueMark 呼吸道检测组合 2.0(TaqMan 阵列卡)表征 41 种呼吸道病毒、细菌和真菌微生物

为了研究宿主靶标的差别基因表达,我们预设计的 TaqMan 基因表达测定产品组合包括超过 230 万种预设计的引物/探针集,涵盖 30 多个种属。  

下表列出了与 SARS-CoV-2 研究相关的一些常被引用的基因。其中许多基因也在我们精心挑选的检测组合中提供,可用于同时分析与 SARS-CoV-2 感染相关的多种宿主基因。

病毒进入因子限制因子细胞因子促炎 & 细胞毒性介质趋化因子&受体其他靶标
ACE2 (232)BST2 (36)IL1B (77)GNLY (21)CCL2 (20)HGF  (217)
ANPEP (220)CH25H (18)IL2 (51)GZMA (51)CCL3 (12)IFIT1 (13)
BSG (85)CLEC4D (44)IL4 (55)GZMB (18)CCL5 (36)IFNGR1 (91)
CLEC4G (78)DNAJC6 (220)IL5 (46)GZMK (43)CCL11 (23)IFNGR2 (61)
CTSB (118)ELF1 (118)IL6 (58)CXCL3 (11)CCL20 (44)IFT43 (133)
CTSL (50)IFIT3 (15)IL7 (66)CXCL9 (38)CCL27 (29)ISG15 (15)
DPP4 (340)IFITM1 (11)IL8 (53) /
CXCL8 (40)
IFNB1 (16)CCR1 (21)KRT4 (63)
FURIN (173)IFITM2 (5)IL10 (66)IFNG (48)CCR5 (22)KRT7 (57)
NRP1 (227)IFITM3 (11)IL12 (186)KLRB1 (27)CXCL1 (17)SCGF (8)
TMPRSS11A (51)LY6E (28)IL13 (45)KLRC1 (31)CXCL3(11)STAT1 (292)
TMPRSS11B (47)REC8 (218)IL16 (164)KLRC2 (10)CXCL9 (38)VEGF (166
TMPRSS2 (124)ZBP1 (76)IL18 (39)KLRD1 (44)CXCL10 (41) 
TMPRSS4 (136)ZC3HAV1 (149) m-CSF (63)CXCL12 (48) 
   MIF (26)  
   PRF1 (21)  
   TGFB1 (83)  
   TGFB2 (86)  
   TNF (58)  
   TNFSF10 (63)  

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TaqMan 灵活阵列包括一个精心挑选并经科学选择的基因表达测定列表,这些测定根据与特异性信号转导通路或疾病状态相关的常被引用的基因而设计。检测组合提供多种配置和种属,可修改以轻松添加或删除测定/目标基因,或更改您所需的设计。

我们目前提供三种针对冠状病毒研究的 TaqMan® 灵活内容检测组合:

检测组合

描述

基因

宿主种属

冠状病毒进入因子

SARS-CoV-2 和其他冠状病毒劫持感染细胞的 13 种常被引用的宿主因子

ACE2、TMPRSS2、TMPRSS4、TMPRSS11A、TMPRSS11B、BSG、ANPEP、CLEC4G、FURIN、CTSL、CTSB、DPP4 和 NRP1


小鼠
大鼠

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已知能抑制冠状病毒生命周期不同阶段的 13 种常被引用的抗病毒宿主因子

LY6E、IFITM1、IFITM2、IFITM3、ZAP/ZC3HAV1、BST2、CLEC4D、ELF1、REC8、IFIT3、DNAJC6、ZBP1、CH25H
小鼠
大鼠

冠状病毒免疫信号转导

涉及对 SARS-CoV-2 和其他冠状病毒的免疫应答的 29 种细胞因子、趋化因子和生长因子

IL1B、IL2、IL4、IL5、IL6、IL7、IL10、IL12、IL13、IL16、IL18、IFNB1、IFNg、TNF、TGFB1、M-CSF/CSF1R、MIF、VEGF、SCGF、HGF、TRAIL/TNFSF10、CCL2、CCL3/MIP1a、CCL5、CCL11、CCL27、CXCL1、CXCL10、CXCL12


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  • 定制 TaqMan 基因表达测定:使用我们的 定制 TaqMan 测定设计工具,以利用我们预设计的实时荧光定量 PCR 5' 核酸酶 TaqMan 测定的精确设计管线。提供您感兴趣的靶标序列,然后提交进行测定设计。
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人 RNase P 对照Hs04930436_g1

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选择用于基因表达分析的预混液,具体取决于您执行 1 步法实时荧光定量 RT-PCR 还是 2 步法实时荧光定量 RT-PCR。1 步法工作流程可减少污染并缩短总体 RT-PCR 运行时间,而 2 步法工作流程可让您保存 cDNA。如果您执行 2 步法实时荧光定量 RT-PCR,您还需要购买用于逆转录反应的其他预混液。

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实时荧光定量 PCR 和数据分析

我们可为所有研究需求提供实时荧光定量 PCR 仪器,从预算友好型到实现较高生产率的高通量仪器。
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COL111051-QS-Pro-FHRamily-4-v2-F-650x600

仅供科研使用,不可用于诊断目的。