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Collibri 链特异性 RNA 文库制备试剂盒，用于全转录组测序
保持转录组的多样性
Collibri Stranded RNA Library Prep Kit for Illumina Systems with Human/Mouse/Rat rRNA Depletion 使用独特的建库方案，adapters 被直接添加到 RNA 上。使用该建库方法，完整的转录组得以保留，因为 cDNA 合成不受 GC 含量的影响，而且随机寡核苷酸序列也未掺入 cDNA 中，从而防止了错误的 SNP 和点突变。
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Figure 1. Sequence the entire transcriptome for improved library complexity. Partial adapters, also known as helper adapters, are ligated directly to single-stranded RNA prior to creation of cDNA. Full-length indexed adapters are generated during PCR.
Figure 1. Sequence the entire transcriptome for improved library complexity. Partial adapters, also known as helper adapters, are ligated directly to single-stranded RNA prior to creation of cDNA. Full-length indexed adapters are generated during PCR.
技术指南：在文库制备过程中如何保持链特异性
检测基因组的哪条链编码基因转录本，并区分在基因组相反链上进行编码的两个不同等位基因。
| Collibri Stranded RNA Library Prep Kit for Illumina with H/M/R rRNA Depletion Kit | |
|---|---|
| 动手操作时间（小时） | 3.5 |
| 总时间（小时） | 6.5 |
| RNA 种类 | 总 RNA |
| 样本起始量范围（ng） | 100–1000 |
| 兼容物种 | 人、小鼠、大鼠 |
| 核糖体去除模块 | 包含 |
| 结果分析难度 | 简单易用 |
技术资料：选择总 RNA 测序还是 mRNA 测序
总 RNA 测序提供最全面的完整转录组分析。如果研究仅集中在编码区域并且可用的初始样本数量有限，则 mRNA 测序是理想的选择。
在建库流程中每个步骤都有颜色变化提示
为了获得高建库成功率，仅当每个步骤试剂正确混合时，试剂中的示踪染料会发生颜色变化。如发现颜色无变化，则表示需要暂停实验，待完全混匀后再继续。直观的颜色变化提示有助于监控自动化建库系统的建库效果。
RNA-Seq 文库制备的技巧建议
Collibri Stranded RNA Library Prep kit 的研发科学家分享了他们的建库技巧，以保留完整转录组信息。
推荐对照
建议在建库之前将 Invitrogen ERCC RNA Spike-In Control Mix（Collibri 试剂盒中未提供）添加到起始 RNA 模板中。 其提供了一组外源 RNA 对照，可以对用于基因表达研究的多种技术平台进行性能评估（动态范围，检测下限，差异倍数）。了解详细信息，请查阅ERCC RNA Spike-In Control Mixes 用户指南
图 2.ERCC Spike-In Mixes 中的转录物摩尔比。Spike-In Mix 1 和 Spike-In Mix 2 中的转录本分为四个亚组，其分子浓度比为定义的Mix 1:Mix 2。每个亚组包含跨度 106 倍浓度范围的 23 个转录物，其转录物大小分布和 GC 含量大致相同。
对于阳性 RNA 对照，我们推荐 Universal Human Reference RNA 或 Human Brain Total RNA。
提示： 请勿将 ERCC RNA Spike-In Control Mix 与 FFPE RNA 等高度降解的样品一起使用。高质量的 ERCC RNA 可以与低质量的 RNA 竞争，从而导致 ERCC RNA 的量在最终文库中过多。
全转录组测序文库制备流程
保留编码和非编码 RNA 的多样性
我们提供一系列 Invitrogen RNA 提取试剂盒，用于从多种起始材料中进行灵敏、可规模化的核酸纯化，以实现高效纯化和下游实验高性能。包括用于从各种样本（如组织、细胞、血液、血清、植物、法医样本等）中进行 RNA 纯化的多种试剂盒。
使用基于磁珠的纯化技术和 KingFisher 仪器来结合、洗涤和洗脱 RNA，从而实现自动化 RNA 提取，不仅可以减少动手操作时间，同时可保持高产量和出色的可重复性。
灵敏而特异的核酸定量
使用 Qubit 荧光检测平台，可以高灵敏度和高特异性地快速准确定量 RNA。从多种类且高灵敏度的 RNA 定量试剂中进行选择，以准确定量 RNA 文库。
推荐相关产品
- 如果您需要更改实验通量，可将 96 孔 0.2 mL 模块与另一模块互换
- 通过移动应用程序远程（方便地）访问 PCR 系统
- 使用简单易用的触屏界面在几秒钟内对仪器进行程序设置
- VeriFlex 模块可实现精确的 PCR 优化或进行多达6个独立实验
- 易于使用的图形界面（6.5 英寸 VGA 触屏）
- 使用更快的梯度变化速率，减少了 PCR 循环时间
可扩展通量的文库定量
基于 qPCR 的 Collibri 文库定量试剂盒 可用于大批量样本的文库定量，同时也是对珍贵样本或临床样本进行文库定量的理想方法。 定量准确性与 KAPA 文库定量试剂盒相当，此外在定量过程中还具有颜色变化提示。
Qubit dsDNA HS Assay 是一种荧光检测试剂，使用 dsDNA 结合染料来准确定量 NGS 文库浓度，每个样品只需几分钟的简单检测流程。
无论选择哪种检测方法，都离不开良好的实验操作技术，以确保准确定量文库浓度和获取高质量的 Illumina 测序数据。
推荐相关产品
借助 Applied Biosystems QuantStudio 实时定量 PCR 系统，您可体验到卓越的性能、可靠性和世界一流的服务支持，从而获得真正的价值。我们的系列仪器可助您获得所需的结果，与同事建立联系和协作，实现您的研究目标。
保留编码和非编码 RNA 的多样性
我们提供一系列 Invitrogen RNA 提取试剂盒，用于从多种起始材料中进行灵敏、可规模化的核酸纯化，以实现高效纯化和下游实验高性能。包括用于从各种样本（如组织、细胞、血液、血清、植物、法医样本等）中进行 RNA 纯化的多种试剂盒。
使用基于磁珠的纯化技术和 KingFisher 仪器来结合、洗涤和洗脱 RNA，从而实现自动化 RNA 提取，不仅可以减少动手操作时间，同时可保持高产量和出色的可重复性。
灵敏而特异的核酸定量
使用 Qubit 荧光检测平台，可以高灵敏度和高特异性地快速准确定量 RNA。从多种类且高灵敏度的 RNA 定量试剂中进行选择，以准确定量 RNA 文库。
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可扩展通量的文库定量
基于 qPCR 的 Collibri 文库定量试剂盒 可用于大批量样本的文库定量，同时也是对珍贵样本或临床样本进行文库定量的理想方法。 定量准确性与 KAPA 文库定量试剂盒相当，此外在定量过程中还具有颜色变化提示。
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无论选择哪种检测方法，都离不开良好的实验操作技术，以确保准确定量文库浓度和获取高质量的 Illumina 测序数据。
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仅供科研使用，不可用于诊断目的。