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低丰度(1 ng)和高丰度(500–1,000 ng)样品之间的变异检测是一致的,从而可靠分析各种样品。
对于各种大小基因组的高覆盖度可提高对宿主病原体研究的准确性,例如,研究宿主对 SARS-CoV-2 的敏感性等快速建库方案,可在短短 1.5 小时内即可完成,且可与 Illumina 所有 NGS 系统兼容
测序研究现在不仅可以应用于更多类型样本,而且可对基因组进行可靠解析。使用 Invitrogen Collibri PS DNA Library Prep Kits for Illumina Systems ,不管是扩增文库
图 1.将 Coriell NA12878 DNA 制备成文库,并在 Illumina™NovaSeq™ 6000 系统上测序,每个样本的测序数据为 372M reads。使用 FreeBayes v1.2.0 计算 SNP recall。
变异检测的一致性使得对于多种样本均可获得更加一致且可预期的结果。使用Invitrogen Collibri ES DNA Library Prep Kits for Illumina Systems ,不管对于扩增文库(100 ng)还是 PCR-free 文库,其进行变异检测的效率相似。
图 2.将 Coriell NA12878 DNA 制备成文库,并在 Illumina NovaSeq 6000 系统上测序,每个样本的测序数据为 258M reads。使用 FreeBayes v1.2.0 计算 SNP recall。
“…in a 1/10th reaction with Collibri preps, you can see really tight performance.”
Dr. Stuart Levine, Director of the BioMicro Center, MIT
Collibri PS DNA Library Prep Kits for Illumina Systems | Collibri ES DNA Library Prep Kits for Illumina Systems | |
PCR-free 建库方案样本起始量 | 500 ng | 100 ng |
样本起始量 | 1–1,000 ng | 1–500 ng |
最低的 GC 偏好性 | ||
DNA 片段化方法 | 物理片段化(例如 Covaris) | 酶片段化 |
适用的物种 | 所有 | 所有 |
PCR-free 建库方案实验时间(小时) | 1.5 | 1.5 |
实验时间(小时) | 2.75 | 2.5 |
PCR-free 建库方案的动手操作时间(小时) | 0.5 | 0.5 |
动手操作时间(小时) | 1 | 1 |
目标片段大小(bp) | 350-550 | 350-550 |
包含所有建库所需组分 | ||
颜色变化提示 | ||
查看性能数据 | 查看性能数据 |
根据对基因组均匀覆盖度、高产量和易于自动化等方面的需求,选择合适的 DNA 片段化方法。
仅供科研使用,不可用于诊断目的。