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以蛋白质组等多组学整合为基础的生命组学,为基因组提供了更接近表型的验证和解释,为癌症早期发现、良恶性诊断、分型和个性化用药、疗效监测和预后判断等提供了更精确、更可靠的信息,使精准医学更加精准。
参考文献
蛋白质组加入“癌症登月”计划
2016年7月,国立癌症研究所(NCI)、国防部(DoD)、美国退伍军人事务部(VA)三部门联合宣布建立第一个同时进行基因和蛋白信息表征的医学系统,对癌症病人进行个性化蛋白基因组表征,为更快速、更精准地用药提供指导。同时,CPTAC宣布进行TCGA肿瘤活检样本蛋白基因组的第三期研究,开展大规模临床试验,验证蛋白质组和修饰组层面的癌症表征对更快速、更精准地制定治疗方案的指导作用。
蛋白质组加入癌症登月计划及乳腺癌、卵巢癌蛋白基因组分析成果
人类蛋白质组草图
2014年,人类全蛋白质组草图绘制完成,这是继人类基因组计划后的第二个生命科学里程碑。时至今日,1个小时即可完成酵母全蛋白质组分析、1天时间即可完成人全蛋白质组的深度覆盖(>50%基因产物)分析。这些成果均得益于静电场轨道阱Orbitrap超高分辨质谱技术,使蛋白质组已经能够像基因组一样,作为常规分析手段,大规模应用于临床研究与检测。
A draft map of the human proteome (Nature, 2014, 509: 575)(人类蛋白质组草图)
Mass-spectrometry-based draft of the human proteome (Nature, 2014, 509: 582)
3个小时从采血到出报告
蛋白质组真正用于临床检测需要从样本前处理到获得结果的一整套简单、快速的分析流程。基于Orbitrap开发出的临床蛋白质组检测流程,从指尖采血、到大规模自动化的样品前处理、到30分钟的快速质谱分析、再到高通量数据处理并最终获得报告,全程只需要3个小时,能获得300多种蛋白的定量结果,其中包含近50种FDA批准的疾病标志物。
Plasma Proteome Profiling to Assess Human Health and Disease (Cell Systems, 2016, 2: 185)