福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本为基因表达谱分析和基因表达定量测定带来了独特的挑战,包括 RNA 分子的化学修饰和片段化。由于 RNA 降解随时间推移增加,因此 FFPE 样本的存档也成为挑战之一。因此,并非所有 FFPE 样本都含有高质量 RNA。

主要特点

  • 使用 Paradise® QC 试剂盒可确保下游步骤成功进行
  • 畅享适合处理福尔马林固定样本的完备系统带来的好处


Arcturus® Paradise® PLUS 样本质量评估试剂盒提供了一种简单的解决方案,用于在进行激光显微切割和下游分子分析之前评估从福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织中提取的 RNA 质量。试剂盒中提供的试剂经过优化,能够高效提取、分离和逆转录 FFPE 组织刮片中的总 RNA。之后使用实时荧光定量 PCR 测定 RNA 的数量和质量(图 1)。

RNA 的数量和质量是通过特定信息的完整 RNA 的存在来评估的。采用实时荧光定量 PCR 技术,以两组设计用于扩增 β-肌动蛋白靶序列内的短 DNA 片段的 β-肌动蛋白基因特异性引物来估计给定样本中与 β-肌动蛋白含量相关的 RNA 量。使用来源于 3′ 引物集的 RNA 量来定量测定 FFPE 组织刮片中的 RNA。从两组 PCR 引物得到的 RNA 得率的比率是 3'/5' 比值,并被用作 RNA 质量的指标。

 图 1.实时结果确定了可在进一步实验中使用的高质量样本。

使用 Paradise® QC 试剂盒可确保下游步骤成功进行

畅享适合处理福尔马林固定样本的完备系统带来的好处

Paradise® PLUS 试剂系统是一款少有的解决方案,它提供了从 FFPE 组织样本中制备 RNA 以进行基因表达分析所需的所有组分。为确保获得成功的微阵列结果,该系统包含了经过优化、可实现出色 RNA 回收和优异 RNA 扩增的试剂。


完备的微基因组学系统

Paradise® PLUS 试剂系统已作为 Arcturus® 完备系统(一种利用少量 RNA 进行基因表达分析的集成式解决方案,适用于 Microgenomics®)的一部分进行了验证,并且配备了用来获得纯细胞群的 Arcturus 激光捕获显微切割 (LCM) 仪器。适用于 Microgenomics® 的 Arcturus 系统可实现准确、灵敏的微阵列测定,这些测定可揭示在全组织样本或细胞混合物中会被掩盖的分子特征。