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不止测序

DNA 片段分析可实现细胞系的各种应用
非整倍体检测。虽然测序技术(如新一代测序 (NGS))也能实现这些应用,但研究人员选择片段分析来实现多重复区的检测、更快的周转时间以及更高的灵敏度和分辨率等特征。

片段分析由于其具有多重检测能力,也更加经济;通过使用不同颜色染料标记基因座特异性引物来区分重叠基因座的等位基因,从而能够在一次运行中分析20多个基因座。

片段分析如何运行?

Applied Biosystems 基因分析仪的另一大功能

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手册:毛细管电泳法 DNA 片段分析

了解我们多重荧光片段分析工作流程中每个步骤的完整解决方案。

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应用和方法

细胞系的错误识别会产生误导性的结果,造成混乱,并增加研究成本。现在,许多期刊和资助机构都要求研究人员鉴定他们使用的细胞系是真实的。片段分析可提供细胞系的简单、经济和高度特异的遗传“指纹”。

Sanger 测序是测定单基因序列、确认基因突变、检测重复序列、拷贝数变异和单核苷酸变化的金标准。Sanger 测序是小规模项目和 NGS 结果确认的理想选择,可以补充您实验室的技术,实现高效的 SARS-CoV-2 研究。

微卫星标记是包含重复核苷酸序列的多态性 DNA 基因座,通常每个重复单位有2到7个核苷酸。对于单个微卫星基因座内的大多数重复,重复单元的长度是相同的,但特定基因座的重复数量可能不同,从而产生不同长度的等位基因,这可以通过毛细管电泳的片段分析进行分析。

CRISPR-Cas9 系统是简单、精确且广泛采用的基因组编辑技术,基于简单的细菌免疫系统的组成部分。在任何基因组编辑实验中,修复过程并不完全有效或准确的。片段分析可用于筛选初级转化培养物,以确定编辑效率。

相对荧光定量测定(或定量荧光 PCR (QF-PCR))是一种用于多种片段分析应用的技术,需要对多份样本进行准确的峰高比较。利用这项技术的研究应用包括评估杂合性缺失 (LOH)、非整倍体测定和检测大染色体缺失。

单核苷酸多态性 (SNP) 基因分型是基因变异的衡量标准。SNP 基因分型用于研究遗传性状、疾病易感性和药物治疗应答差异。Applied Biosystems™ SNaPshot™ 多重检测试剂盒是一款稳定的 SNP 分析工具。该试剂盒可在单管、单毛细管形式的单碱基延伸过程中实现多达10种引物 - 模板组合的多重检测。

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相对荧光定量测定(或定量荧光 PCR (QF-PCR))是一种用于多种片段分析应用的技术,需要对多份样本进行准确的峰高比较。利用这项技术的研究应用包括评估杂合性缺失 (LOH)、非整倍体测定和检测大染色体缺失。

细菌人工染色体 (BAC) 经过开发,可容纳的 DNA 片段比质粒大得多。它们可以用来对生物体的基因组进行测序,并为遗传疾病建模。

SSCP 分析可以检测序列变异(单点突变和其他小规模变化)。它是一种广泛使用的筛选方法,借助此方法可以鉴定大量样本和从微生物到人类的多种生物中的不同基因组变异。

当使用限制性片段消化 DNA 并用电泳通过大小进行分离时,DNA 序列多态性显示出与野生型片段模式不同的迁移谱。 RFLP 分析有助于识别疾病的特定基因在染色体上的位置,并确定可能有疾病风险的个体或突变基因的携带者。



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知识积累

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仅供科研使用,不可用于诊断目的。