使用 Genexus 一体式测序仪进行冠状病毒 (SARS-CoV-2) 研究

微生物学家和病毒学家面临的主要挑战是预测疾病病原体的进化和出现方式。冠状病毒等 RNA 病毒具有高遗传变异性的生物学特征，此特征导致其发生大量突变。冠状病毒变体也可源于蝙蝠、蛇、穿山甲等动物传染源中的抗原转移。

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Ion Torrent 靶向新一代测序 (NGS) 简化了研究工作流程，以便对 SARS-CoV-2（导致 COVID-19 的冠状病毒）进行完整基因组测序和流行病学研究。通过联合使用一组高特异性的通用冠状病毒引物与高保真预混液，所有基因组片段均在 Ion Torrent Genexus 一体式测序仪的自动化工作流程中进行扩增、测序和分析。使用这种新 NGS 解决方案可以在一天内快速从核酸获得基因变异报告，同时最大限度缩短手动操作时间。

 Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight Research 检测试剂盒 包含2个扩增子池，扩增子的长度范围为 125-275 bp，可完全覆盖超过 99% 的病毒基因组和变异类型。

适用于 Genexus 一体式测序仪的 Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight Research 检测试剂盒的优势包括：

• 快速周转时间——较快的 NGS 工作流程，适用于传染性疾病研究中有时效性要求的用途
• 自动化——自动设置和设置好的工作流程可以减少用户手动操作，降低用户导致的误差，增加结果的可重现性
• 变异检测准确度高——更少的SNV替代错误
• 较高的成功率——直接分析样品，且病毒载量低 
• 较高的分辨率，较长的 NGS 读长——准确、快速的病毒分型，适用于病毒监测和流行病学调查