KingFisher 系统可以处理核酸、蛋白质和多肽、细胞和外泌体等多种应用。

 

不同的样品类型和应用需要不同的化学成分才能提取分析物。例如,血液、唾液和口腔样品是长片段 DNA 的浓缩来源,而游离 DNA 样品是短片段的大体积、低浓度来源。使用不同的磁珠、不同的结合方式和缓冲化学成分,从这些来源获得最佳的 DNA 提取物。

 

在本节中,您可以找到专为 KingFisher 系统优化的试剂盒、试剂和方案,以最大程度提高每个提取靶标和样品类型的纯度和产量。表格总结了每种分析物和应用的建议方法。

MagMAX 核酸试剂盒是使用 KingFisher 系统自动提取 DNA 或 RNA 的首选试剂。

agMAX 核酸试剂盒

试剂盒、试剂和方案选择指南

使用我们的选择工具为您的自动化样品制备找到合适的磁珠试剂盒。MagMAX、Dynabeads 和 SMART Digest 试剂盒可以从各种样品类型中纯化核酸、 蛋白质、 细胞、外泌体 和病毒, 并专门为自动化  KingFisher 纯化系统而优化。 

直接进入我们的试剂盒、试剂和规程选择指南查看


下载方案

KingFisher BindIt 或 BindIx 软件随所有 KingFisher 仪器免费提供,以便您创建、 下载、运行、 修改和存储 适合您应用的方案。 该软件允许您为方案的每个部分(结合、洗涤和洗脱)定义和编辑步骤、参数、孔板和试剂。

 

有关任何 MagMAX 或 Dynabeads 试剂盒或各试剂盒中的试剂、试剂和方案选择指南,请单击 View Protocols(查看方案)以查看 KingFisher 仪器的自动化方案。然后按照以下步骤下载并安装所需的方案。

KingFisher BindIx 软件(用于 KingFisher APEX 系统

KingFisher BindIt 软件(适用于 KingFisher FlexDuo Prime 系统

  1. 确保您在使用 KingFisher 仪器的电脑上安装了 BindIt 4.1 软件。在此处下载最新的 BindIt 软件。
  2. 在试剂盒、试剂和方案选择指南中找到您需要的试剂盒,然后单击 View Protocols(查看方案)。您将看到该试剂盒的产品页面。
  3. 滚动至底部的“方案”部分,然后单击要下载的方案。确保它适用于正确的仪器。
  4. 将方案保存在您的计算机的首选文件夹中。
  5. 用 USB 线把您的 PC 连接到 KingFisher 仪器上,并在 BindIt 软件中选择 Home > Connect(主页 > 连接)。
  6. 您可以从 BindIt 软件启动方案,也可以将其传输到仪器上。如果您传输方案,请在 BindIt 软件中选择 Home > Transfer(主页 > 传输)。
  7. 选择 Upload(上传),找到保存的方案。单击 Open(打开)。
  8. 选择您要在仪器上储存方案的文件夹(类别)。您的方案现在可以在仪器内存中找到。
  9. 从 BindIt 上断开您的设备,并使用小键盘检查您的方案是否在指定的文件夹中。

SARS-CoV-2

KingFisher 系统拥有该领域的前沿技术 ,可以帮助实验室增加 RNA 提取通量以满足快速及准确地大批量处理 SARS-CoV-2 检测结果的需求。 KingFisher 仪器上的 MagMAX 病毒/病原体试剂盒为  SARS-CoV-2  检测提供了一种灵敏、简单的核酸提取方法, 最近已简化了方案以进一步提升通量。 

样品病毒/病原体分析工作流程

样品病毒/病原体分析工作流程

基因组 DNA 研究

从不同样品类型中分离基因组 DNA (gDNA) 过去一直需要多个纯化试剂盒。使用 MagMAX DNA Multi-Sample Ultra 2.0 试剂盒或  KingFisher Flex Ready DNA Ultra 2.0 预分装板和 KingFisher 仪器可以从 50 μL 到 2 mL 全血、唾液、血沉棕黄层、口腔拭子或其他生物样品中分离 gDNA。得到的纯化 gDNA 是许多下游分子生物学应用的理想选择,如 qPCR、NGS 和微阵列分析。

 

适合下游基因分析的一种 易获取、非侵入且可靠的 gDNA 来源是 唾液。MagMAX gDNA 唾液试剂盒是为一家领先的基因组公司使用 KingFisher 仪器而开发,经过专门优化可用于唾液 gDNA 分离。

样品 gDNA 工作流程

样品 gDNA 工作流程

唾液样品 gDNA 工作流程

唾液样品 gDNA 工作流程


游离 DNA 和 RNA

从血浆、血清或尿液中提取游离 DNA (cfDNA) 或总核酸 (cfTNA) 的“液体活检”是一种检测和监测与癌症等疾病状态相关靶标的非侵入性方法。KingFisher 仪器上的 MagMAX 游离核酸试剂盒是液体活检研究的理想选择。对游离 DNA (cfDNA) 和总核酸 (cfTNA)(而非基因组 DNA (gDNA))的富集进行了优化,这意味着更高的回收率和更低的起始体积。 

 

样本 cfDNA 或 cfTNA 液体活检工作流程

样本 cfDNA 或 cfTNA 液体活检工作流程


FFPE DNA 和 RNA

临床癌症研究样本通常采用福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 用于组织病理学分析和组织存档。该方法可保留组织并可长期储存,但大量的核酸化学交联会使下游应用处理(如二代测序 (NGS))变得复杂。

 

使用 MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 试剂盒和 KingFisher 仪器,您可以从 FFPE 和固定样品中按顺序分离 DNA、RNA、microRNA 或同时分离 DNA 和 RNA。提取的基因组 DNA (gDNA) 质量高,产量可与新鲜冷冻血液相当。该试剂盒非常适合用于 Ion Torrent™ Oncomine™ 游离核酸检测以及 PCR 和 NGS,即使超过 25 年历史的 FFPE 组织也同样适用。

FFPE 样品分离工作流程

FFPE 样品分离工作流程


总 RNA 和 miRNA

从不同样品类型中分离不同类型的 RNA 以进行基因表达研究过去一直需要多个纯化试剂盒。MagMAX mirVana 总 RNA 分离试剂盒已经过优化,能够从大多数生物样品(包括血浆/血清、全血、固体组织、培养细胞、尿液等)中提取总 RNA,包括小 RNA 和 microRNA (miRNA)。提取不含酚和有机物。

样品总 RNA 或 miRNA 工作流程

样品总 RNA 或 miRNA 工作流程


mRNA

转录组学研究需要信使 RNA (mRNA),可以来源于多种样本。Dynabeads mRNA 分离磁珠利用大多数 mRNA 3' 末端的 polyA 残基与共价偶联到 Dynabeads 表面的 Oligo(dT)25 残基之间的碱基配对来特异性捕获多种粗样品中的 mRNA 分子。KingFisher 仪器上的自动化方案仅需 15 分钟,分离出的 mRNA 可用于所有下游应用。

样品病毒/病原体分析工作流程

mRNA样品病毒/病原体分析工作流程


病毒/病原体 DNA 和 RNA

检测人类体液中的病毒对于传染病研究和管理至关重要。病毒载量检测可用于评估抗病毒疗法的疗效、并监测疾病进展和揭示在早期阶段是否存在感染。在 KingFisher 仪器上使用 MagMAX 病毒/病原体试剂盒为从包含病毒或其他病原体的样品中提取核酸提供了一种灵敏且简单的方法。

 

注意:有关使用 MagMAX 病毒/病原体试剂盒进行 SARS-CoV-2 检测的具体信息,请参阅以上 SARS-CoV-2 检测 

样品病毒/病原体分析工作流程

样品病毒/病原体分析工作流程


使用 DNA 和 RNA 进行微生物组研究

人类微生物组在疾病诊断和治疗方面已成为关键因素,但对微生物的鉴定和定量却成为了一项重大挑战。尽管宏基因组测序技术可以在环境样本中提供所有基因的全面分析,但该技术需要足够的纯净且高质量的 DNA 和 RNA 样本。MagMAX 微生物组 Ultra 核酸分离试剂盒 和 KingFisher 仪器可以以高效、自动化的工作流程提供样品。

样品微生物组研究工作流程

样品微生物组研究工作流程


用于疾病监测的污水DNA和RNA

废水和污水监测是监测病毒和细菌病原体区域传播的有用工具。在不同的操作层面 (如大学宿舍或整个城市) 进行监测已被证明是在SARS-CoV-2病毒在人群中广泛传播之前检测到它的可靠方法。污水监测可用于监测其他病毒靶标,如流感和诺如病毒。MagMAX污水试剂盒提供了一种高效、简单的方法,从废水、污水或污泥样品中提取高质量的核酸,用于疾病监测工作流程。纯化的DNA和RNA非常适合用于各种下游应用,如qPCR,数字PCR或NGS。

样品污水研究工作流程

样品污水研究工作流程

植物 DNA 和 RNA

从植物中提取 DNA 和 RNA 在处理植物组织中富含的糖类、酚类和其他化合物时具有特殊的挑战。MagMAX™ 植物 DNA 分离试剂盒使用 KingFisher 自动化仪器,可从各种植物物种和组织类型中分离核酸。

植物样品 DNA 工作流程

植物样品 DNA 工作流程

植物样品 RNA 工作流程

植物样品 RNA 工作流程


免疫沉淀

免疫沉淀 (IP) 或免疫共沉淀 (co-IP) 可用于从含有成千上万种不同蛋白的样品中分离和浓缩特定蛋白或蛋白复合物。Dynabeads 磁珠试剂盒可最大程度提高产量和重复性并最大限度减少非特异性结合,已成为用磁珠进行免疫沉淀反应的黄金标准。现在有了适用于 KingFisher 仪器的自动化方案,您可以在 40 分钟内完成蛋白质检测和分析,只需最少的手动操作时间。

样品免疫沉淀 (IP) 工作流程

样品免疫沉淀 (IP) 工作流程


肽图分析与定量

肽图分析是生物医药蛋白表征中的一个关键工作流程,对解析蛋白质的初级氨基酸结构至关重要。 要生成肽图,必须先通过化学反应或酶反应将治疗性蛋白酶解成肽段。但是目前酶解和测序的方法涉及冗长且步骤繁多的手动过程,这些过程的缺点是其重复性、灵敏度和数据可信度较低。

 

Thermo Scientific SMART Digest 磁试剂盒与 KingFisher 仪器配套使用,可以将 24 小时的处理时间缩短至 1 小时或更短,自动化大部分手动操作,消除了变化因素和手动误差的根源。

样品肽图分析工作流程

样品肽图分析工作流程

样品肽定量工作流程

样品肽定量工作流程


细胞和外泌体

在核酸和蛋白质的分子水平以上,Dynabeads 磁珠试剂盒可与 KingFisher 仪器一起用于细胞外泌体的自动分离。例如,使用 Dynabeads 试剂分离、活化和扩增 T 细胞,可用于下游应用,如细胞毒性或基因编辑。可分离和分析外泌体和循环肿瘤细胞 (CTC) 用于液体活检。使用 Dynabeads 试剂有助于确保天然表征良好的高纯度、活的、功能良好的细胞的高产量,同时 KingFisher 系统自动化可减少手动操作时间并提高重复性。